十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”那样的怪物看待，所有人都疏远他。鸣人自小就孤苦无依，一晃十多年过去了，少年鸣人考入了木叶村的忍者学校，结识了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的传人之一，当他还是小孩的时候他的哥哥——一个已经拥有高超忍术的忍者将他们家族的人都杀死了，然后投靠了一直想将木叶村毁灭的大蛇丸，佐助自小就发誓要超越哥哥，为家族报仇。

世界中存在着许多魔导士公会。那里是向魔导士们介绍委托的工会组织。以成为出色的魔导士为目标的少女露西意外的遇到了吃火吐火并且身上缠着火焰的灭龙魔导士纳兹和会说话的蓝猫哈比，并且加入了他们所属的公会妖精的尾巴。虽然被认为是王国中最强大的公会但却满是问题儿童的妖精的尾巴，露西和纳兹和哈比组成了小队，进行着各种各样的委托挑战。

奥村磷自幼被神父藤本狮郎收养，某一日，磷发现了自己其实是撒旦之子的秘密，之后养父的惨死让磷下定居心走上了驱魔师的道路。磷所存在的世界被分为“物质界”和“虚无界”两大空间，人类生存于物质界，在虚无界中，则徘徊着凶残暴戾的魔鬼。 身边接连发生的伤害事件让磷逐渐发现，某些虚无界的恶魔，趁虚而入潜入了人类世界。为了伸张正义保护同类，磷果断的担负起了驱魔的职责。在弟弟奥村雪男（福山润 配音）的帮助下，磷不断的向着真相前进，此时的磷也发现，造成这一切混乱的元凶，可能就藏在他们的身边。