住在以第七迷宫为中心的城镇，支乡的年轻人阿里巴巴，通过做着车夫的打工逐渐实现着自己攻略迷宫，成为大富翁的梦想。这样的一天，他与为寻找『魔神的金属器』而旅行着的迷之少年，阿拉丁相遇了。阿里巴巴在目睹了潜藏于他所持有的笛中的『乌戈君』的力量后，向阿拉丁提出了共同进行迷宫攻略的邀请。 魔笛MAGI第二季全集动画预定播放内容为原作的大圣母篇。

凡多姆海恩家族的宅邸内百花齐放，黑执事塞巴斯蒂安•米卡利斯（小野大辅 配音）进退有节，优雅矜持地招待来访的客人。而庄园的主人夏尔（坂本真绫 配音）则在田中（藤村俊二 配音）、梅琳（加藤英美里 配音）、菲尼（梶裕贵 配音）等仆从的环绕下度过平凡舒适的每一天。这一日，夏尔收到了维多利亚女王的来信。信中称名叫诺亚方舟的马戏团即将巡回来到他们所在的城市，而该马戏团所到之处必然会发生儿童失踪事件。作为“女王的看门狗”，夏尔责无旁贷担负起调查的重任。几经周折，夏尔和塞巴斯蒂安成功混入马戏团，他们在这里见到了各种各样生