十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”那样的怪物看待，所有人都疏远他。鸣人自小就孤苦无依，一晃十多年过去了，少年鸣人考入了木叶村的忍者学校，结识了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的传人之一，当他还是小孩的时候他的哥哥——一个已经拥有高超忍术的忍者将他们家族的人都杀死了，然后投靠了一直想将木叶村毁灭的大蛇丸，佐助自小就发誓要超越哥哥，为家族报仇。

C.E.75，战火仍未消停，独立运动、蓝色宇宙的侵占事件陆续发生……。为了平息事态，以拉克丝为初代总裁的世界和平监视机构——孔帕斯就此创立，基拉等人作为组织成员开始介入各地的战斗。在此情况下，新兴国家芬德申向蓝色宇宙的大本营提议进行共同作战。

大正时代，灶门炭治郎继承亡父留下的炭业工作，支撑一家七口，在山上过着朴实的生活。某日他做完生意返家后发现全家遭鬼王鬼舞辻无惨屠杀，而妹妹祢豆子变成了鬼。鬼杀队富冈义勇见状后本欲斩杀祢豆子，但他在见识到兄妹俩的亲情后，推荐炭治郎拜鳞泷左近次为师。炭治郎经过两年训练，学会对抗鬼的呼吸法与剑术，通过考验加入鬼杀队。炭治郎完成首次任务斩杀沼泽鬼后，又接到任务前往浅草，途中他闻到当年家人被杀害时的残留气味，炭治郎终于和最初的鬼——鬼舞辻无惨——首次接触，令炭治郎震惊无惨竟伪装人类组成家庭。在那之后炭治郎结识与无

魔王被杀死之后的世界。然而还残留着拥有杀死魔王之力的修罗们。一眼就能看出如何杀死对方的剑豪、超越了音速的神速枪兵、同时用三只手臂操持传说武器的鸟龙冒险者、只要一句话就什么都能实现的全能词术士、不可知而司职死亡的天使暗杀者……各种族能力已登峰造极的修罗们，为了寻求更加强大的敌人，追寻“真正勇者”的荣耀，产生了新的斗争的火种。全员皆为最强，全员皆为英雄，而仅一人为勇者。决定“真正之物”的激烈斗争，现在开幕——